Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc179J3QM76 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms