Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21818J3KMS6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm21818J3KMS6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21818J3KMS6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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