Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M1F7CXU4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-M1F7CXU4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms