Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3443F7CCV5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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