Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cfap46E9Q2C0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms