Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifit3bE9PV48 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ifit3bE9PV48 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms