Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5478D3Z6R0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5478D3Z6R0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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