Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms