Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc13D3YV10 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc13D3YV10 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms