Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Siah3B2RWG3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Siah3B2RWG3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms