Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc22a28B2RT89 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc22a28B2RT89 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms