Protein–RNA interactions for Protein: B1B0X0

Gm15107, Predicted gene 15107, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15107B1B0X0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm15107B1B0X0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms