Protein–RNA interactions for Protein: A6H619

Phrf1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phrf1A6H619 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Phrf1A6H619 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phrf1A6H619 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phrf1A6H619 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms