Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc9bA3KGF9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms