Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htra4A2RT60 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htra4A2RT60 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms