Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Samt1A2BED8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms