Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pramef25A2ASI9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pramef25A2ASI9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms