Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syndig1A2ANU3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms