Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2dnl2A2AFH2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms