Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem185aA2AF53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms