Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms