Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Spink4-201ENSMUST00000030122 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ndufs1-201ENSMUST00000027111 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm15964-201ENSMUST00000138207 2745 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Aldh1a1-201ENSMUST00000087638 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm44639-201ENSMUST00000205859 3009 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Aftph-209ENSMUST00000177543 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Fam110b-202ENSMUST00000108380 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdca7Q9D0M2 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms