Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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