Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Hoxb2P0C1T1 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms