Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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