Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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