Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm45629-201ENSMUST00000209629 2546 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Nqo1-201ENSMUST00000003947 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Olfr806-203ENSMUST00000215142 3108 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Mettl6-209ENSMUST00000228727 2388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 AC122397.1-201ENSMUST00000228650 2819 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sox12Q04890 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms