Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PtprdQ64487 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtprdQ64487 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PtprdQ64487 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PtprdQ64487 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PtprdQ64487 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PtprdQ64487 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PtprdQ64487 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtprdQ64487 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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