Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Usp9yF8VPU6 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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