Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AireQ9Z0E3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AireQ9Z0E3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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