Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme3Q9WV85 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme3Q9WV85 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms