Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx6Q9R1R0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lhx6Q9R1R0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms