Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Psma4Q9R1P0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psma4Q9R1P0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms