Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfwd2Q9R1A8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfwd2Q9R1A8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms