Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clec4eQ9R0Q8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clec4eQ9R0Q8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms