Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed2Q9R0Q3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed2Q9R0Q3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms