Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt3Q9QZ47 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt3Q9QZ47 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms