Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad18Q9QXK2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad18Q9QXK2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms