Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Calm4Q9JM83 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Calm4Q9JM83 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms