Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rabgef1Q9JM13 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rabgef1Q9JM13 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rabgef1Q9JM13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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