Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rcan3Q9JKK0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rcan3Q9JKK0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms