Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms