Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip1Q9JJ57 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnip1Q9JJ57 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms