Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms