Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf21Q9EPU5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms