Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlr1Q9EPQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms