Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rp2Q9EPK2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rp2Q9EPK2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms