Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Xab2Q9DCD2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Xab2Q9DCD2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms