Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med29Q9DB91 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Med29Q9DB91 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms