Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pop5Q9DB28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pop5Q9DB28 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms